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게놈소식지

NGS TREND

• 최신 NGS 기기동향 (기기별 성능 비교)
• 완전 자동화 프로세스를 통하여 1200샘플의 엑솜 캡처를 일주일만에 완료
• NGS 기술의 현재: NGS 기술의 임상 적용 Yes or No?
• 생명정보 데이터 분석 방법의 현재
• NGS 수행하는 우리들의 자세, 10계명
• CLIP and PAR-CLIP sequencing 분석
• 맞춤의료에 이용된 차세대 해독 기술
• 암게놈 패널을 이용한 정확한 백혈병 변이 검색
• DTC 유전검사에 대한 임상 유전학자들의 생각
• 전장유전체 연관분석과 질병위험의 평가
• 마이크로칩으로 분리된 CTC의 WES
• Cancer Panel을 이용한 연구

• 파이썬을 이용한 생명 정보 데이터 기초분석 교육

TRENDS

• 게놈연구재단 박종화 소장님의 ENCODE 프로젝트에 관한 의견
• 합성생물학, 방두희 교수님과의 인터뷰
• 생물정보연구소 소장, 김선 교수님과의 인터뷰
• “질병유전체분석법” 저자, 아산병원 이종극 교수님과의 인터뷰
• 생물정보학 교육현장, 김상수 교수님과의 인터뷰
• 젊은과학자, 단국대학교 한규동 교수님과의 인터뷰
• 집단유전학의 전문가, 김희발 교수님과의 인터뷰
• 맞춤의학 현장에서, 최형진교수님과의 인터뷰
• 당뇨병의 약물유전체학과 개인 맞춤형 의료에 대한 최형진 교수님 의견
• 생명정보의 메카, 국가생명연구자원정보센터(KOBIC)의 박기정센터장님 인터뷰
• 박기정센터장님의 국가생명연구자원정보센터(KOBIC) 소개
• 한국유전체학회 회장, 고대안암병원 김열홍 교수님과의 인터뷰
• 미생물융합기술과 생물정보학, 서울대학교 천종식 교수님과의 인터뷰
• 세계 최초 호랑이 게놈 분석에 참여한, 조윤성연구원과의 인터뷰

 

NEWS

• 맞춤 치료시대…맞춤형 의약품 개발 ‘활짝’
• 한국인 최초 유전체 표준지도 초안 완성
• ENCODE PROJECT
• 유전체 분야 최대 학회 ASHG를 알아보다
• Genomic medicine, 맞춤의료 시대에 생각해야 할 것들
• 게놈분야의 새로운 "career"
• 세계 각지의 게놈을 연구하는 곳
• Genome History
• 유전자검사에 대한 각국의 정책
• 국제 심포지엄을 통한 전 세계 암 유전체 시장
• 생화학.분자생화학 학회를 다녀와서...
• 식품의약품안전처 바이오의약품 국제 전문가 포럼 참관 및 Avison Biomedical symposium 2013
• 국립암센터 국제 심포지엄 참관기
• 한국육종학회 참관기
• 이동성 유전인자(Mobile genetic elements) 분과 심포지엄
• 2013 Microbiomics and Metagenomics Workshop
• 삼성유전체 연구소 개소기념 심포지엄
• 한국인 변이체 참조표준 데이터 공개
• 한국인 변이체 참조표준 데이터 2015년도 업데이트
• '명견만리' <유전자 혁명, 선택의 기로에 서다>, 박종화 박사 강연
• BMC Medical Genomics - Published: 30 April 2016
• Agedit DB 개발
• 한국인 게놈지도 참조표준 공개
• 한국인 변이체 참조표준 데이터 2016년도 업데이트
• 한국인 변이체 참조표준 데이터 2017년도 업데이트
• 한국인 변이체 참조표준 데이터 2019년도 업데이트

REVEIWS

• 세계 최초 한국표범 게놈지도 완성
• 한국 독수리 게놈 세계 최초 분석
• 세계 최초의 밍크고래 게놈지도 공개
• 한국인 미만성 위암 게놈 분석결과 공개
• 서열 데이터에서 bias를 줄이기 위한 방법
• NGS를 사용한 단일유전자성 당뇨병의 유전 진단
• 암 게놈에서 체세포 구조 변이의 다양성 메커니즘
• 유전적 심장질환을 임상적 분자진단에 이용하는 Bench-Top 게놈 해독기 비교
• 면역과 특정 알레르기 관련 유전자위치 확인
• 쌍봉낙타와 단봉낙타의 종간 비교를 통한 개체 수 돌연변이 비율 추정
• 성조숙증의 원인이 되는 MKRN3 유전변이
• 선천적인 호중구 결핍 증후군과 VPS45 변이
• 느리게 진화하는 계통의 생리적 급변 모델, 서부 거북의 게놈으로 보다
• 글리슨점수에 따른 전립선암의 차이는?
• Charlevoix-Saguenay(ARSACS) 질환의 원인 변이, SACS
• 신생대의 마지막 홍적세(Pleistocene)의 조기 말의 게놈 서열을 이용하여 말의 진화를 측정
• 겨울에도 꽃이 지지 않는 인동의 게놈은 어떻게 생겼나?
• 티베트 영양의 게놈에서 고산지대에 서식하는 방법을 배우다
• 선천성 심장질환에서 게놈을 이용한 새로운 변이 발견
• 신경퇴행을 유발하는 돌연변이?
• 연꽃 게놈 해독, 1300년 장수 비밀이 풀렸다
• 유전적 돌연변이에 의한 열성형질, 백호
• 전장게놈 분석과 질병위험의 평가
• 침팬지 게놈에 있는 Alu 재조합에 의한 구조적 결실
• 포도상구균의 인수공통성 감염연구에 NGS를 이용하면?
• 조직 재생에 관련된 붉은점영원(Natophthalmus viridescens)의 전사체 특징
• 네 가지 촌충의 게놈에서 기생 생활의 특징을 확인
• 척추동물의 진화를 바다 칠성 장어 게놈에서 확인하다!
• 비수술적 방법으로 종양의 획득저항성을 추적하다
• 게놈분석을 통해 삼림의 적, 소나무좀을 알아보다!
• DTC(Direct To Consumer) 유전자 검사가 미치는 영향
• 새로운 분자 진단 방법을 소개합니다!
• 살아있는 화석, “아프리카 실러캔스” 게놈에서 사지동물의 진화 역사를 보다
• 암 게놈 현황과 미래 비젼
• NGS를 이용한 미토콘드리아 관련 질병의 분자학적 진단
• 나무타기 쥐의 특이한 유전적 특성을 규명하다!
• 니콜레이즈-버레이터 증후군 관련 새로운 돌연변이 발견
• 정제되지 않은 암 샘플에서 체세포 변이를 검출하는 MuTect
• 복숭아(Prunus persica) 게놈의 진화 패턴에 따라 나타나는 유전적 다양성
• 다른 해양 종에 비해 매우 낮은 유전적 다양성을 가진 대왕오징어(Architeuthis DUX.)
• STAMBP 유전자 변이에 의한 모세혈관 기형으로 소두증
• 게놈에서 포식성 조류(매; Falco peregrinus, Falco cherrug)의 생활방식을 엿보다!
• 유방암과 전립선암의 희귀한 기능 변이 추정
• 밀의 게놈, Triticum urartu에서 유전되다
• 단일 세포에서 SNV와 CNV 감지
• 유전정보, DNA를 이용한 개개인의 식별
• HIV-1 수용체의 친화성을 4가지 플랫폼의 NGS로 확인
• 골형성에 관여하는 유전자 ERF의 감소와 두개골 유합증
• 양비둘기(rock pigeon)의 유전체 다양성과 진화
• 대규모 엑솜 분석 수행으로 알아본 인간의 유전변이
• 중국 Tianyuan 동굴에서 현대 인류의 초기 DNA를 분석
• 배추좀나방의 유전체에서 초식성을 확인하다!
• 개인게놈해독서비스전망
• 동글동글 조롱박 식물과 다양한 수박 유전체
• 암환자의 유전자에서 염색체를 감지하다
• 폐선암의 특징을 NGS를 통해 알아보자
• SF3B1 유전자 변이에 의한 맥락막 흑색종
• 희귀 난치 질환, 뮤코다당증의 진단
• Adieu 2012! 되돌아보는 2012년 10대 뉴스
• 박쥐는 어떻게 장시간 비행이 가능할까?
• 양서류는 어디서 왔나요?
• 장미과의 매화, 기원을 찾아서
• 운남성 흑염소의 모낭은 뭔가 다르다?
• 실존하는 늑대인간? 암브란스 증후군
• CLDN2 유전자 변화로 나타난 췌장암
• 사람과 개의 마지막 사슬
• 아토피에 연관된 유전 부위가 따로 있다?
• 돼지 유전체 해독으로 얻은 포유류의 진화 분기
• 치명적인 소아암 ‘신경아세포종’의 유전자 변이
• 개인 유전체 테스트 시장의 대중화를 위한 단계적 모델
• 세포별 유전체에 담긴 면역결핍, 자가면역, 아밀로펙틴증 정보
• 류마티스 관절염도 유전적 치료가 가능하다
• 반복된 염기서열을 이용한 비단뱀과 두마리 새의 유전체 해독
• GWAS 분석으로 확인한 얼굴 형태를 결정짓는 유전자 위치
• NGS를 이용한 후추(Piper nigrum L.) 전사체 해독
• HiSeq2500으로 50시간 내에 이루어진 신생아의 유전자 질병 진단
• 엑솜시퀀싱(Exome sequencing)으로 중증 지적 장애 진단
• De novo 분석으로 Anopheles gambiae 유전체 해독
• 보리게놈의 해독으로 맛있는 맥주를?
• 엑솜시퀀싱과 전장유전체 시퀀싱으로 임상테스트를?
• 급성 출혈성 발열과 관련된 Rhabdovirus 유전체 해독
• KCNT1 유전자의 새로운 기능, 채널 돌연변이
• 1,092명의 인간 게놈 변이지도를 통합해내다!
• Footprint 분석으로 인간의 전사 조절을 밝혀내다!
• 인간 유전체의 염색질 주변을 접근하다!
• 인간 세포의 전사체 비밀을 풀어내다!
• 유전자 암호화 영역에서 조절 네트워크를 발견하다!
• 인간게놈의 DNA 통합 백과사전의 발견!
• 유전자간 장거리 상호작용의 결과, 발현!
• 신경 교종 중 가장 악성인 교모세포종의 원인은 유전자 돌연변이?
• 식중독 살모넬라균의 질병 변이, 대륙을 건너다
• 소형 유전체 해독기 개발 경쟁의 중심, MiSeq vs Ion Torrent
• 임진년 흑룡과 닮은 생물 찾기
• 최초 토마토 전장 염기서열 해독 논문 발표
• 아이의 유전형에 따라 독감백신의 효과가 달라진다.